No internet connection

Сайт вопросов-ответов (аналог StackOverflow) в рамках курсов Информатики в ВШЭ и Молекулярного Моделирования.

Это сайт для тех, кто хочет уметь делать на компьютере НЕ только то, чему его научили:
В работе программиста (да и квантового химика) часто встречается ситуация, когда понятно, что надо сделать, но неизвестно, как. Например: удалить папку на UNIX, или поправить инпут-файл, чтобы расчёт перестал падать с непонятной ошибкой.
Основной способ решения данного класса задач: зайти в Гугл, сформулировать свою проблему и найти для неё решение. Те из вас, кто так уже делал, наверняка видели, что очень часто ответы находятся на сайте StackOverflow: это сайт вопросов-ответов, который активно используется программистами. Есть даже такая народная мудрость: если у вас есть проблема в программировании, то вы не первый, кто с ней столкнулся, и правильный ответ точно есть где-то на просторах интернета.
Однако, сайты вопросов ответов тоже создаются не сами по себе: всегда есть кто-то, кто задал вопрос, ответ на который помог вам. Поэтому полезно уметь вернуть долг и в свою очередь задать вопрос/дать ответ на таком форуме.

Полезная пара вопрос/ответ должна быть оформлена так, чтобы быть полезным случайному читателю. Для этого:

  1. Название вопроса должно содержать сообщение об ошибке, либо другие ключевые слова, по которым легко понять, о чём идёт речь.
  2. В теле вопроса должна быть детально изложена проблема в текстовом виде. Также необходимо описание последовательности действий, приведшей к проблеме, и фрагменты инпут/аутпут-файлов (обязательно корректно оформленные как код). Недопустимо чтобы формулировка ошибки присутствовала в вопросе только в виде картинки - такой вопрос - а значит, и ответ на него - не будет находится поисковыми системами и будет бесполезен для общества.
  3. Ответ на вопрос должен содержать конкретное решение (что ввести в командную строку/поменять в инпут-файле чтобы проблема решилась) и объяснение проблемы в целом. Например:
    На сервере установлено всего 12 Гб оперативной памяти, а в инпут-файле указано использовать 25 Гб. Нужно заменить %maxcore 25000 на %maxcore 2000 (тогда будет 2 Гб, должно хватить).
  4. Если ответ решил проблему - он обязательно должен быть отмечен как "Solution" - для того, чтобы посетитель форума мог быстро найти нужный (работающий) ответ.
  5. Все детали обсуждения должны присутствовать на странице вопроса. Никаких "я прислал тебе в ВК", "посмотри в ТГ". Опять таки, такой вопрос/ответ будет бесполезен для общества.

Topics, recently active firstCategoryUsersRepliesActivity
ORCA не считает
Походу, у меня ошибка в инпут-файле, но я не могу ее найти, помогите, пожалуйста!
GeneralKK2S92020-12-11 11:28:00.904Z
Долгие расчёты
Нормально ли, что Орка остановилась на этом моменте и считает его уже около 12 часов?
GeneralSSS32020-12-11 11:03:53.046Z
Орочка на видюхе
Как уломать орку вести расчеты на видеокарте? Можно ли параллельно считать на видюхе и проце?
ORCATS12020-12-11 10:59:42.814Z
Можно ли дублировать вывод лога? (Linux & Windows)
Можно ли дублировать вывод лога, то есть в консоль и в лог-файл?
ORCADB12020-12-10 19:39:21.947Z
Пауза
Как Орочку на паузу поставить, я хочу в киберпанк поиграть
ORCATDT22020-12-10 13:41:42.726Z
file orca_tools/Tool-Scanner/qcscan1.cpp, line 88
друзья, смотрите, что не так в моем инпуте? ! def2-SVP ! CPCM(water) ! OptTS TightOpt % geom * xyz 0 1 8 -3.923200000 -6.471100000 -1.521500000 6 -2.347100000 -4.753400000 -2.269800000 6 -2.906400000 -3.374000000 -2.678300000 1 -2.162500000 -2.875500...
GeneralMK2M22020-12-10 06:36:49.214Z
CANNOT OPEN FILE Filename: \FileName_property.txt
!!! FATAL ERROR ENCOUNTERED !!! !!! ----------------------- !!! !!! CANNOT OPEN FILE !!! !!! Filename: C:\Users\kcree\...
GeneralKD12020-12-09 22:08:51.581Z
Оптимизация с мнимой частотой
Что можно сделать, чтобы не оптимизировать заново молекулу, если в результате расчета возникла мнимая частота?
ORCAMK212020-12-09 18:11:05.881Z
ORCAK2M12020-12-09 18:08:46.718Z
the flag for use of LIBINT has been found
Кто-нибудь сталкивался с таким?
GeneralMMM22020-12-09 15:35:40.588Z
Explain icons...
Может ли ORCA поменять количество связей?
Расчет идет уже долго, но я обратила внимание, что в output-файле при открытии его в ChemCraft строение кластера поменялось: исчезли связи Me-Me. Это просто интерпретация ChemCraft такая, не связанная с расчетом?
ORCAS2MM2S242020-12-09 14:02:24.423Z
Запуск расчёта на сервере
Не получается запустить расчёт на сервере. Следовала инструкциям, но я что-то явно делаю не так. Помогите, пожалуйста! Инпут создала в своей директории
ORCAS2K2DSS2252020-12-09 12:31:22.084Z
ошибка в инпуте
В чем ошибка в инпуте? %pal nprocs 8 end ! PBE0 Grid4 D3BJ ! cc-pVDZ ! TightOpt Freq xyz 0 1 C 17.678212593 -10.227698742 -23.762138129 H 17.678212593 -11.143245483 -23.167770754 C 17.678212593 -9.025478852 -23.181585067 H 17.678212593 -8.138315963 -...
GeneralPK2M2S32020-12-08 12:59:47.793Z
открытие орка
Командная строка не открывает орку, "отказано в доступе". Орка в path есть.
GeneralPM262020-12-08 09:22:37.387Z
Orca выдаёт ошибку
Если у кого-то была такая ошибка, подскажите, пожалуйста, что можно сделать? Заранее спасибо.
GeneralSMSS62020-12-08 08:15:13.670Z
Error: number expected in COORDS/XYZ/SecondCoordinate ATOM-NO 1
Копировала координаты из ChemCraft в инпут, запустила программу, выдает ошибку: Error: number expected in COORDS/XYZ/SecondCoordinate ATOM-NO 1 . Что не так? Координаты представлены на скрине Инпут: ! CPCM(water) ! TightOpt Freq * xyz 2 1 Ta 0,...
ORCAS2DSK2M112020-12-07 21:04:32.116Z
Как исправить данную ошибку?
Уже на двух расчетах. Проверил с простым аммиаком такого не появляется
GeneralMSM32020-12-07 20:48:51.210Z
Кто сильнее медведь или акула?
Очень интересно стало
GeneralTBKT52020-12-07 20:02:21.877Z
Как запустить расчет на нескольких ядрах?
Как запустить расчет на нескольких ядрах?
ORCANK212020-12-07 18:28:53.481Z
Координаты в инпут файл
Как создать координаты для инпут файла или где их можно взять? Заранее спасибо)
ORCADKK222020-12-07 17:58:05.336Z
Учет сольватации, растворители
Где можно найти список растворителей, чтобы правильно написать команду учета сольватации?
GeneralBK252020-12-07 17:32:22.295Z
Получение наночастиц сферической формы
Создаю вопрос для того, чтобы инструкцию Артёма по использованию https://colab.research.google.com/drive/1WgxEk1VQwzNRctveC02fwP-4s1bbZlzv?usp=sharing#scrollTo=a3KZpbvq0ohZ могли видеть все (он попросил это сделать на сайте).
GeneralSSS22020-12-07 17:10:35.075Z
ORCA на linux
Где можно добыть ORCA на linux, и как его там запустить?
ORCABSB22020-12-07 15:58:16.196Z
Где можно посмотреть ИК-спектр определенного вещества?
Где можно посмотреть ИК-спектр определенного вещества?
GeneralBK212020-12-07 15:57:59.642Z
нахождение TS
Хочу расчитать предполагаемое YS такой инпут файл ! PBE0 Grid4 D3BJ def2-svp PAL3 ! TightOpt ! CPCM(water) xyz 0 1 C -11.562 0.047 H -11.734 0.058 H -11.520 1.216 O -10.685 -0.400 H -12.575 -0.458 N -10.315 -0.801 O -9.363 -0.289 в терминале выдает э...
ORCAKSK22020-12-07 11:36:34.948Z
Работа с программой Mercury
Вопрос такой. Мне нужно нарисовать структуру CeO2 из n атомов, у него кубическая кристаллическая решётка, которую нужно превратить в сферу. Михаил Геннадьевич посоветовал воспользоваться программой Mercury. В связи с этим вопрос: работал ли кто-то в ...
IdeasSMMS72020-12-07 11:23:29.270Z
ChemCraft
По каким причинам файл не сохраняется в формате .inp?
GeneralKK2SK82020-12-07 08:09:21.323Z
Переходное состояние
У меня есть оптимизированный продукт и реагент.(оба посчитаны) Как мне найти переходное состояние ?
ORCAKS12020-12-07 00:12:23.155Z
ChemCraft
Вопрос, пожалуй, глупый, но как сделать тройную связь между атомами в ChemCraft?
GeneralKD12020-12-06 19:58:19.887Z
Вопрос по мультиплетности
А как вообще считать мультиплетность и у всех ли молекул будет 0 электронов?
GeneralM2K2M222020-12-06 18:35:06.064Z
Как запустить ORCA на windows, чтобы она не вылетела при закрытии командной строки?
Как запустить ORCA на windows, чтобы она не вылетела при закрытии командной строки?
ORCAMSMDM292020-12-06 17:52:24.185Z
Sample idea
This is a sample idea. Click the idea icon to the left of the title (i.e. ) to change status from New Idea, to Planned, to Started, to Done. In the topic list, everyone sees the status of the idea at a glance — the status icon is shown to the left (e...
IdeasS52020-12-06 14:42:10.448Z
Sample discussion
This is an open ended discussion. Good comments rise to the top, and people can click Disagree to show that they disagree about something.
GeneralS32020-12-06 14:42:10.387Z
Welcome to this community
[ Edit this to clarify what this community is about. This first paragraph is shown to everyone, on the forum homepage. ]
GeneralS02020-12-06 14:42:10.331Z