нахождение TS
Хочу расчитать предполагаемое YS
такой инпут файл
! PBE0 Grid4 D3BJ def2-svp PAL3
! TightOpt
! CPCM(water)
- xyz 0 1
C -11.562 0.047
H -11.734 0.058
H -11.520 1.216
O -10.685 -0.400
H -12.575 -0.458
N -10.315 -0.801
O -9.363 -0.289
в терминале выдает это
[file orca_main/maininp2.cpp, line 465]: Error: number expected in COORDS/XYZ/ThirdCoordinate ATOM-NO 1
Вроде инп файл нормальный , как исправить ?....
- SАртем Глубшев @someanonimcoder
Во-первых, все примеры кода/инпутов стоит оформлять вот так:
! PBE0 Grid4 D3BJ def2-svp PAL3 ! TightOpt ! CPCM(water) *xyz 0 1 C -11.562 0.047 H -11.734 0.058 H -11.520 1.216 O -10.685 -0.400 H -12.575 -0.458 N -10.315 -0.801 O -9.363 -0.289 *Во-вторых, пардон, а почему координат две? У каждого атома должно быть x,y,z или по крайней мере у всех кроме первых двух, если геометрию представить в виде Z-matrix. Добавка нуля в качестве третьей координаты для всех атоммов заставила этот файл корректно считаться(впрочем, очевидно бессмысленно с химической точки зрения). Поставь корректные координаты по z- получишь осмысленный результат
- KЕгор Кретов @Kretov
господи....забыл третью координату добавить . Спасибо!!!