No internet connection
  1. Home
  2. ORCA

Переходное состояние

By Егор Кретов @Kretov
    2020-12-06 23:11:59.837Z

    У меня есть оптимизированный продукт и реагент.(оба посчитаны)
    Как мне найти переходное состояние ?

    • 1 replies
    1. S

      Нарисовать что-то навскидку исходя из википедии/литературы, потом сделать optTS. Если не работает - сначала констрейним интересующие нас части, потом оптимизируем нормально(opt), потом optTS. Констрейны делаем так:

      ! BP86 def2-SVP def2/J Opt
      %geom
      Constraints
      {B 0 1 C} # B for Bond, C for Constraint
      end
      end
      

      Выше в примере был привязвн атом 1 к 0. Почему необходимо делать констрейны? - А потому что иначе оптимизация сведет ПС или в реагент или в продукт. Так что надо сначала зафиксировать все что не надо оптимизировать, оптимизировать остаток молекулы, и оптимизировать уже как TS