Error: number expected in COORDS/XYZ/SecondCoordinate ATOM-NO 1

2020-12-07 14:44:12.780Z2020-12-20 20:59:38.568Z

Копировала координаты из ChemCraft в инпут, запустила программу, выдает ошибку: Error: number expected in COORDS/XYZ/SecondCoordinate ATOM-NO 1 . Что не так? Координаты представлены на скрине

Инпут:

! CPCM(water)
! TightOpt Freq
* xyz 2 1
Ta       0,782674866     -0,506238333     -4,391218391
Ta      -0,815434096      1,735287515     -3,580480924
Ta       2,682168629      0,063462573     -2,236104276
Ta       1,105764549      2,320667491     -1,411930637
Ta      -0,250182113     -0,335600425     -1,599803735
Ta       1,980332325      2,120861887     -4,192137086
Br      -0,671102759     -2,312379811     -3,199231570
Br      -2,662738893      0,500683447     -2,216784923
Br       0,093234586      3,442635608     -5,328546346
Br       4,431711981      1,393084683     -3,684665785
Br      -0,191849458      1,187334982      0,544665143
Br       2,111328233      0,642767450     -6,317591912
Br       3,318656179      1,610589273     -0,230687665
Br       1,823908765     -1,659017989     -0,477440091
Br      -1,545561183      0,261824333     -5,603416832
Br       2,430500552      4,172343721     -2,647721387
Br      -1,069530070      3,711540600     -1,899318238
Br       2,994117896     -1,933414085     -3,882804088
*

Solved in post #8, click to view

Reply

11 replies

S
Света Краснова @svetakrasnova
2020-12-07 14:57:02.678Z
Саша, может быть, ошибка есть в самом инпут-файле. У меня было то же самое из-за того, что в конце не поставила звёздочку.
Reply
K
In reply toSashaEvs⬆:
Fedor Kliuev @KliuevFS
2020-12-07 14:57:27.452Z
Прикрепи, пожалуйста инпут свой.
Reply
1. S Саша Евстигнеева @SashaEvs
  2020-12-07 14:58:51.462Z
  прислала
  Reply
D
In reply toSashaEvs⬆:
Danis Zaripov @dzaripov
2020-12-07 15:30:17.227Z
мне кажется, что нужно использовать как разделительный знак "." вместо ","
Reply
Progress
S
Саша Евстигнеева @SashaEvs
2020-12-07 14:58:36.937Z
Reply
K
Fedor Kliuev @KliuevFS
2020-12-07 15:00:35.834Zreplies toSashaEvs⬆:
желательно файлом, чтобы я попробовал у себя запустить
Reply
S
Саша Евстигнеева @SashaEvs
2020-12-07 15:02:22.492Zreplies toKliuevFS⬆:
В тг прислала
Reply
K
Fedor Kliuev @KliuevFS
2020-12-07 15:20:07.228Z2020-12-17 18:11:55.085Zreplies toSashaEvs⬆:
Он почему то ругался на твои координаты. Я сдвинул твой кластер, чтобы координаты поменялись (абсолютно, но не относительно). Также вроде ты ик хотела посчитать для катиона, наверное всё-таки надо учесть сольватацию растворителем.

! HF-3c
! TightOpt Freq
! CPCM(water)

xyz 2 1
Ta -0.616129930 -2.695818516 -3.963619462
Ta -2.214238892 -0.454292668 -3.152881995
Ta 1.283363833 -2.126117610 -1.808505347
Ta -0.293040247 0.131087308 -0.984331708
Ta -1.648986909 -2.525180608 -1.172204806
Ta 0.581527529 -0.068718296 -3.764538157
Br -2.069907555 -4.501959994 -2.771632641
Br -4.061543689 -1.688896736 -1.789185994
Br -1.305570210 1.253055425 -4.900947417
Br 3.032907185 -0.796495500 -3.257066856
Br -1.590654254 -1.002245201 0.972264072
Br 0.712523437 -1.546812733 -5.889992983
Br 1.919851383 -0.578990910 0.196911264
Br 0.425103969 -3.848598172 -0.049841162
Br -2.944365979 -1.927755850 -5.175817903
Br 1.031695756 1.982763538 -2.220122458
Br -2.468334866 1.521960417 -1.471719309
Br 1.595313100 -4.122994268 -3.455205159

Думаю проблема в том, что у тебя запятые, а не точки в качестве разделительного знака.
Reply Solution
S
Саша Евстигнеева @SashaEvs
2020-12-07 15:21:57.197Zreplies toKliuevFS⬆:
С катионом все неточно. Дело в том, что по литературным данным его Ик спектр схож со спектром Ta6Br14*8H2O , вот я и подумала, что не стоит учитывать сольватацию. Или всё же стоит?
Reply
K
Fedor Kliuev @KliuevFS
2020-12-07 15:26:12.407Zreplies toSashaEvs⬆:
Не понял почему не стоит учитывать, я бы учёл, но наверное нужно услышать Михаила Геннадьевича.
Reply
M
Michael Medvedev @Medvedev_MG
2020-12-07 21:04:32.116Zreplies toSashaEvs⬆:
Если кластер в реальности (когда снимается ИК-спектр) находится в сильно полярной среде (полярный растворитель/кристалл), то лучше сольватацию учесть.
Reply

Reply (discussion)