Отрицательные частоты
Это третий раз, когда появляются отрицательные частоты. Предыдущие два я брала оптимизированную геометрию и создавала новый импут с новыми координатами. Всё прекрасно посчиталось, вот только частоты остаются отрицательными.
- KFedor Kliuev @KliuevFS
Выбираешь мнимую частоту, у тебя молекула начнет колебаться, поджидаешь момент, когда конфигурация на твой взгляд наиболее стабильная (например, ты узнала длину связей Ni-N в этом комплексе) и останавливаешь, тыкая на кнопку "Freeze" (например, когда у тебя длина связи становится нужной). Открываешь координаты и вставляешь в новый инпут. А еще переделай, пожалуйста это из дискуссии в проблему
https://quantchem.talkyard.net/-38- AАня Афанасьева @avafanaseva
я читала твой ответ Мише, да. Но я не понимаю, какая в моем случае конфигурация в моем случае будет наиболее стабильной.
- KFedor Kliuev @KliuevFS
я предполагаю, что у тебя колеблеться связь Ni-N в одной из колебаний, узнай длину связи в этом комплексе и выстави такую длину связи.
- AАня Афанасьева @avafanaseva
нет, там водороды на аммиаках, но ладно, я попробую с этим что-то сделать
- KFedor Kliuev @KliuevFS
Тогда узнай длину связи в аммиаке
- M
- AАня Афанасьева @avafanaseva
да, у меня получилось их устранить